HUBULO-Ibadah Amaliyah merupakan salah satu program pendidikan yang telah dijalankan Pesantren HUBULO sampai saat ini. Perjalanan pembinaan tersebut terus berproses dan mengalami perubahan sedikit demi sedikit. Perubahan tersebut dilakukuan sebagai upaya peningkatan kwalitas output santri. Kegiatan pembimbingan ibadah amaliyah tidaklah semata-mata bersifat materi hafalan yang dilafal oleh santri, namun menjadi alat ukur santri untuk melanjutkan dikelas berikutnya yang pada akhirnya menjadi amalan kehidupan sehari-hari.

Kegiatan ibadah amaliyah ini juga salah satu bentuk pembentengan diri dari pengaruh negatif arus globalisasi yang sudah menggerus integritas dan moralitas santri. Pesantren HUBULO sebagai sebuah lembaga pendidikan memiliki tanggung jawab yang besar untuk membentengi santri sebagai generasi penerus bangsa dari pengaruh negatif globalisasi tersebut. Untuk menghidupkan kegiatan tersebut perlu dilakukan evaluasi dan ujian komperhensif di akhir tahun pelajaran untuk siswa kelas III TMI atau kelas IX MTs Hubulo dengan melakukan Imtihan Syamil

Adapun tujuan dilaksanakan imtihan syamil ibadah amaliyah untuk kls III TMI adalah melaksanakan agenda pendidikan Pesantren HUBULO, menghidupkan kembali nilai-nilai ibadah sehari-hari sehingga menjadi karakter dalam kehidupan santri, meningkatkan mutu output santri dan memberikan bekal dengan hafalan Al-Qur'an serta doa sehari-hari yang kelak menjadi amalan ibadah mereka.

Sementara jumlah peserta yang mengikuti imtihan syamil ini berjumlah 123 Orang dengan rincian 54 santri putri dan 69 santri putra. Sedangkan penguji pada imtihan syamil tahun 2021 ini berjumlah 5 orang mereka adalah Ust. Ikromi, S.HI, Ust. Yasir Faisal, S.Pd, Ust. Syamsul Hadi, SE, Ustazah Erawaty Lihawa, S.HI dan Ustazah Siti Ianah, S.Pd. Materi ujian adalah Juz 30 dari surah an-naba' sampai surah an-nas.`Kegiatan ini dilaksanakan selama 5 hari, dimulai pada Hari sabtu (3/4) sampai Hari Rabu (7/4) dan dibuka langsung oleh Kepala Madrasah Tsanawiyah HUBULO Ustazah Erawaty Lihawa, S.HI